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Hallo Matthias

Ich sehe da erstmal 2 Möglichkeiten.
Check bitte mal, ob der Eintrag root /pfad/zu/Document/root; stimmt

Hast du php5-fpm installiert, wie hier beschrieben http://my5cent.spdns.de/banana-pi/banana-pi-nginx-mysql-und-php5-install... ?
Wenn nicht, ist der Eintrag in der Konfig-Datei von nginx

location ~ \.php$ {
fastcgi_split_path_info ^(.+\.php)(/.+)$;

# With php5-cgi alone:
fastcgi_pass 127.0.0.1:9000;
[...]

Versuch mal, ob das weiter hilft.

Gruß Bjoern